TFBS记录结合信号
ChIP-seq峰提示目标蛋白在一个区域富集，位置精度仍受片段长度、抗体与比对影响。
从结合峰到功能验证
基因组证据图谱
HERV/LTR调控研究包含序列motif、转录因子结合、开放染色质、染色质状态、表达关联和扰动实验。每条轨道回答的问题不同。HSRE观察家族共享结构
多序列比对中的共享motif可以提供演化线索，不代表每个拷贝在所有细胞中活跃。
DHS和ATAC反映开放状态
开放染色质会随细胞和刺激改变，合并数据时必须保留来源。
功能验证需要扰动
删除、motif突变和CRISPR干预更接近因果，结论仍限于具体位点和条件。